Laboratoř vznikla jako podpůrné pracoviště, které zajišťuje očištění a evidenci archeologických předmětů získaných terénními výzkumy institutu. K další významné součásti činnosti laboratoře patří plavení archeobotanických vzorků a jejich příprava k odbornému vyhodnocení. Od roku 2004 laboratoř provádí konzervaci skla, dřeva, usně a železa. Jako součást ošetření předmětů nabízí vyhotovení podrobné kresebné a fotografické dokumentace.